Metabarcoding del gen ARNr 16S

Fundamento

Se amplifica una región variable del gen ribosomal 16S, común a todas las bacterias pero con zonas que difieren entre taxones; los amplicones se secuencian masivamente y se comparan contra bases de datos taxonómicas para reconstruir la composición de la comunidad.

Analito (qué se mide)

Comunidad microbiana

Matriz (en qué muestra)

Suelo / agua / barro / intestino

Equipamiento necesario¿Dónde lo compro?

Termociclador; secuenciador de segunda generación; fluorómetro; servidor o equipo para análisis bioinformático.

Reactivos¿Dónde lo compro?

Cebadores de regiones V3-V4; polimerasa de alta fidelidad; kits de preparación de biblioteca; perlas de purificación; controles de comunidad simulada.

Material de laboratorio¿Dónde lo compro?

Placas; gradillas magnéticas.

Consumibles¿Dónde lo compro?

Celdas de flujo; puntas con filtro.

Unidad

Abundancia relativa (%) · N.º de ASV/OTU · índices de diversidad

Rango de referencia

Profundidad típica: 20.000-50.000 lecturas por muestra

Norma que lo exige

Ley 24.051 de residuos peligrosos y su Decreto 831/93, Anexo II, Tabla 9, niveles guía de calidad de suelo según uso agrícola, residencial e industrial para el seguimiento de suelos en remediación; Ley 22.428 de fomento a la conservación de los suelos y regímenes provinciales de conservación y de buenas prácticas agrícolas

Edición y vigencia de la norma

Esta técnica no responde a una norma única: se aplica con procedimientos internos validados por cada laboratorio, o forma parte de un método más amplio que sí tiene norma. Si el resultado va a usarse con fines regulatorios o legales, hay que acordar de antemano el procedimiento y su validación.

Volumen de muestra

250 a 500 mg de suelo o barro, o 1 L de agua filtrada

Conservación y transporte

Tubo estéril congelado a −20 °C, o a −80 °C si el análisis demora. Nunca a temperatura ambiente: la comunidad microbiana cambia en horas y es justamente lo que se está midiendo.

Límite de detección típico

Del orden del 0,1% de abundancia relativa

Incertidumbre típica

Alta y difícil de acotar: depende de los cebadores, del paso de PCR y de la base de referencia

Área

Biología molecular; Ambiental; Suelos y sustratos

Fecha de última actualización: 3/9/2026