Concentración · Genómica microbiana
Secuenciación de genoma completo bacteriano y tipificación multilocus (MLST)
Reemplaza a varios ensayos de una vez: identifica la especie, el tipo de secuencia, los genes de resistencia y los de virulencia en una sola corrida, y con la mayor resolución posible para investigar un brote.
- Fundamento
- El ADN se fragmenta y se le agregan adaptadores para armar la librería, que se secuencia por síntesis. Las lecturas se ensamblan en contigs y se comparan con bases de datos curadas para asignar especie, secuencia tipo y detectar genes de resistencia y de virulencia.
- Analito (qué se mide)
- Genoma bacteriano completo
- Matriz (en qué muestra)
- ADN bacteriano purificado
- Equipamiento necesario¿Dónde lo compro?
- Secuenciador de nueva generación; fluorómetro; analizador de fragmentos; servidor de análisis bioinformático.
- Reactivos¿Dónde lo compro?
- Kits de preparación de librería; adaptadores con índices; reactivos de secuenciación; patrones de cuantificación.
- Material de laboratorio¿Dónde lo compro?
- Tubos de baja adsorción; pipetas de precisión; perlas magnéticas de purificación.
- Consumibles¿Dónde lo compro?
- Kits de librería; celdas de flujo; reactivos.
- Unidad
- Secuencia tipo (ST) · genes detectados · SNPs de diferencia · cobertura ×
- Rango de referencia
- Para brotes se usa un umbral de pocos SNPs de diferencia entre aislamientos relacionados
- Norma que describe la técnica
- Protocolos PulseNet WGS; esquemas MLST de PubMLST
- Edición y vigencia de la norma
- Esquemas PubMLST, actualización continua
- Volumen de muestra
- 0,5 a 1 µg de ADN genómico de alta calidad, o un cultivo puro para extraer
- Conservación y transporte
- El ADN va en tubo con buffer TE, congelado a −20 °C, con relación 260/280 entre 1,8 y 2,0 y sin degradación visible. Evitar congelar y descongelar repetidamente: fragmenta el ADN y arruina el ensamblado. Los cultivos viajan en medio de transporte o en placa sellada.
- Límite de detección típico
- Detecta genes presentes en una sola copia con cobertura suficiente
- Incertidumbre típica
- Depende de la profundidad de lectura: por debajo de 30× de cobertura el ensamblado pierde confiabilidad
- Área
- Biología molecular; Microbiología
Fecha de última actualización: 8/9/2026
¿Quién lo hace?
658 laboratorios trabajan en estas áreas.
Sin confirmación del laboratorio, el cruce es por área de trabajo y no por esta técnica en particular: conviene preguntar antes de mandar la muestra.
…y 628 laboratorios más en estas áreas. Buscalos con los filtros.
Qué significa verificado. Que le escribimos al mail de contacto público del laboratorio y desde ahí nos respondieron confirmando sus datos y los ensayos que realiza. La verificación se renueva una vez por año.
Otras técnicas de Biología molecular
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